La langue la plus largement parlée est la japonais, qui est différencié en plusieurs dialectes et le Tokyo dialecte est considéré comme la langue japonaise standard . En plus de la langue japonaise, on trouve les langues Ryukyuan parlés à Okinawa et dans quelques parties de Kagoshima au îles Ryuku. Avec la japonaise , ces langues sont parmi de la famille de la langue japonaise , mais ce sont des langues distinctes et ne sont pas mutuellement intelligibles avec les Japonais ou les uns avec les autres. Toutes les langues parlées de Ryukyuan sont classées par l’UNESCO comme en voie de disparition.

à Hokkaido, ily’a les langues Ainu , parlés par les Ainu , qui sont les peuples indigènes au Japon . La langue Ainu est isolée et depuis la période Meiji, les japonais sont devenus largement utilisés parmi les Ainu, et par conséquence, les langues Ainu ont été classés en danger critique par l’Unesco . En outre, des langues telles que Orok, Evenki et Nivkh parlé dans le sud de Sakhalin, anciennement contrôlée par le Japon, sont de plus en plus menacées. Après que l’Union soviétique a pris le contrôle de la région, les locuteurs de ces langues et leurs descendants ont migré vers le continent japonais et existent encore, mais en petit nombre.

Les locuteurs coréens, chinois et zainichi coréens, issus du coréen, résident également au Japon.Longtemps, certains croient que les gens qui habitaient le Japon et ses îles depuis le début de l’âge paléolithique, ont parlé une langue; mais on ignore quel genre de langage ils auraient pu parler.

*La langue Ainu 
Il existe des endroits dans et autour de Tohoku dont les noms proviennent des langues d’Ainu. Il est bien connu que les gens de Hokkaido, de Karafuto et des Kuriles utilisaient les langues d’Ainu, mais on pense aussi que les gens de la partie orientale du continent japonais ont déjà parlé ces langues. Selon les enregistrements du 16ème siècle, les langues d’Ainu n’avaient pas d’alphabet. Seulement à partir du 19ème siècle, les langues Ainu ont commencé à utiliser le katakana.

*La langue Orok 

Les Langues Orok ont émergé avant l’ère commune. Les dossiers montrent qu’ils ont été utilisés pendant la dernière partie de la période Edo à Hokkaido, Karafuto et aux îles Kuriles; cependant il n’y’ a que quelques orateurs encore existants. De plus , les langues Orok n’ont pas d’alphabet .

* La langue Ryukyu